241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4678 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
386 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  97.92 
 
 
386 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  94.55 
 
 
386 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  77.31 
 
 
392 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  75.26 
 
 
388 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  73.49 
 
 
399 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  55.12 
 
 
397 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  53.02 
 
 
393 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  54.12 
 
 
396 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  53.79 
 
 
396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  51.31 
 
 
393 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  54.07 
 
 
396 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  52.49 
 
 
397 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  46.95 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  44.76 
 
 
392 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  46.11 
 
 
399 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  41.1 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  41.21 
 
 
395 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  41.21 
 
 
395 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  44.95 
 
 
384 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  40.44 
 
 
394 aa  256  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 
391 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  42.23 
 
 
386 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 
407 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 
379 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  42.63 
 
 
387 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  43.57 
 
 
379 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  42.62 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  43.27 
 
 
379 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  40.94 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  40.16 
 
 
387 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 
384 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  35.7 
 
 
381 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  39.11 
 
 
378 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  39.89 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  39.61 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  39.44 
 
 
392 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 
375 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  38.22 
 
 
384 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 
389 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 
380 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 
375 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  39.61 
 
 
380 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.83 
 
 
376 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.21 
 
 
383 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  37.32 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.01 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.82 
 
 
378 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 
386 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 
393 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
376 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 
371 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 
394 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 
394 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  38.98 
 
 
381 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 
383 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 
398 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 
398 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 
394 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.82 
 
 
377 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 
382 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  38.6 
 
 
384 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 
398 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 
380 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 
392 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  38.11 
 
 
377 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.57 
 
 
377 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  38.52 
 
 
388 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  38.9 
 
 
390 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.35 
 
 
385 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 
385 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  38.37 
 
 
385 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.88 
 
 
379 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
379 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 
389 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  36.78 
 
 
402 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 
383 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 
393 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 
392 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.74 
 
 
380 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 
389 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.13 
 
 
379 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  36.43 
 
 
382 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  37.06 
 
 
385 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.06 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.83 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 
368 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 
389 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  35.69 
 
 
367 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.91 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 
389 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 
399 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>