244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 392 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  72.31 
 
 		 393 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  64.43 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  59.02 
 
 		 390 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  73.52 
 
 		 393 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  58.51 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  48.45 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  48.96 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  51.04 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  48.71 
 
 		 385 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 386 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 386 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  46.91 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  48.47 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  45.74 
 
 		 384 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  44.92 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 384 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  36.06 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.35 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 380 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  31.98 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  31.97 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.32 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.36 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  34.35 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  32.37 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.97 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  32.24 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  32.4 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.2 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  32.25 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34.35 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.18 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  26.37 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.73 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.43 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.09 
 
 		 377 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  33.64 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  29.02 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  32.77 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  30.83 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  29.3 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  31.28 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  34.81 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  31.33 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  30.9 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.11 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  34.26 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>