240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1391 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  100 
 
 		 378 aa  780    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  54.47 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  52.17 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  50.8 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  50.27 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  49.59 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  49.33 
 
 		 372 aa  342  9e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  44.47 
 
 		 370 aa  338  8e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  47.81 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  41.94 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  32.35 
 
 		 383 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.07 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  32.1 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  31 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.95 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  31.68 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  32.26 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.29 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.35 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  29.37 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  31.72 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.69 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  33.03 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  32.61 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  30.42 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  31.33 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.87 
 
 		 376 aa  189  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.66 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  31.28 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.06 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.54 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  29.28 
 
 		 419 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  27.93 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  30.67 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  30.41 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>