240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0448 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 383 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  57.22 
 
 		 402 aa  457  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  56.35 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  54.5 
 
 		 380 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  56.2 
 
 		 380 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  55.56 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  53.44 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  37.1 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 		 376 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 377 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 384 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.63 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  38.36 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  35.52 
 
 		 410 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.45 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  33.42 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.51 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 388 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  35.98 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.15 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  32.22 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  30.98 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.23 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  30.37 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  30.22 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.84 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.25 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  31.53 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.36 
 
 		 392 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  32.57 
 
 		 378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  31.51 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>