248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2185 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 376 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  63.93 
 
 		 376 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  62.94 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  51.91 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  43.63 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  39.52 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 384 aa  269  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  38.85 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  41.4 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  39.1 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 389 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  37.23 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  35.91 
 
 		 367 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.04 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 368 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.7 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 377 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.16 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  37.33 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  36.16 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  36.39 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.38 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.01 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.98 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.2 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 385 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.26 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  33.9 
 
 		 392 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.9 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.72 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.05 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  38.58 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  32.1 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  37.09 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  37.32 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  32.59 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.8 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>