241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1286 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 368 aa  717    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  36.77 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.04 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.33 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  36.39 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.42 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.62 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  34.01 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  37.88 
 
 		 410 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.13 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.54 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.13 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.17 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.18 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.01 
 
 		 380 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.36 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.46 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.32 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  27.61 
 
 		 363 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  37.65 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  33.23 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  27.37 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  31.4 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 379 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  26.96 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  31.25 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  26.7 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  26.63 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.34 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.06 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  32.83 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>