240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0336 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
364 aa  732    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  94.78 
 
 
364 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  96.15 
 
 
364 aa  711    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  84.07 
 
 
364 aa  620  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  56.01 
 
 
344 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  54.7 
 
 
347 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  56.51 
 
 
344 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  55 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  49.58 
 
 
343 aa  311  7.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  46.03 
 
 
348 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 
388 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 
402 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 
381 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
380 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
383 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  27.03 
 
 
384 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 
368 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  29.44 
 
 
383 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 
380 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  27.59 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  31.41 
 
 
401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 
384 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  26.71 
 
 
379 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  29.2 
 
 
388 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 
401 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  27.53 
 
 
386 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  29.17 
 
 
383 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  30.11 
 
 
388 aa  149  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  27.49 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 
376 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 
389 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  34.26 
 
 
355 aa  146  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  28.02 
 
 
392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.81 
 
 
379 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 
380 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  27.79 
 
 
380 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 
383 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 
380 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.69 
 
 
392 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  27.49 
 
 
380 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  26.81 
 
 
384 aa  143  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.11 
 
 
367 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 
379 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.75 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  31.53 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
382 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  30.41 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.13 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  29.41 
 
 
396 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28.01 
 
 
388 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  26.94 
 
 
376 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.37 
 
 
378 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 
382 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
376 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 
372 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  31.32 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  26.01 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  26.95 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  29.17 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  28.84 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  25.15 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  26.98 
 
 
387 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  27.46 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  29.52 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  27.43 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  27.43 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  31.1 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 
363 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
402 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  27.76 
 
 
410 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  26.8 
 
 
389 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  27.53 
 
 
382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  29.18 
 
 
380 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.82 
 
 
378 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  27.78 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  27.37 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  26.51 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  26.84 
 
 
377 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  29.54 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  27.14 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  27.49 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  27.43 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  30.18 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  27.71 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  28.4 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>