240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1311 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
344 aa  699    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  66.57 
 
 
343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  62.39 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  63.05 
 
 
344 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  56.75 
 
 
364 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  56.01 
 
 
364 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  55.77 
 
 
364 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  56.28 
 
 
364 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  52.63 
 
 
343 aa  345  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  49.13 
 
 
348 aa  321  9.000000000000001e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.67 
 
 
387 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  31.21 
 
 
368 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 
383 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  33.63 
 
 
388 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.34 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  30.06 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  28.87 
 
 
381 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
355 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 
379 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.91 
 
 
378 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  29.76 
 
 
384 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  32.14 
 
 
402 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 
383 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 
383 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  28.31 
 
 
392 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.17 
 
 
367 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.23 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  29.76 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 
384 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.71 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
380 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 
380 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.64 
 
 
393 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 
371 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  31.4 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  28.33 
 
 
380 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.8 
 
 
376 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.39 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  28.83 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  29.25 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
376 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 
383 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  28.74 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 
380 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  28.88 
 
 
410 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 
384 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  29.66 
 
 
386 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  30.84 
 
 
385 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  29.18 
 
 
375 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  29.3 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  31.39 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  29.28 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.27 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  29.18 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 
372 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
392 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  30.28 
 
 
384 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  28.57 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 
363 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  25.07 
 
 
387 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 
396 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  29.57 
 
 
376 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  28.33 
 
 
375 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
375 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  29.51 
 
 
385 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  27.15 
 
 
379 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 
393 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 
389 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 
379 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  28.21 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  29.54 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  26.09 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  26.8 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  27.04 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.47 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  27.04 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  30.06 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  27.04 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  28.27 
 
 
380 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  28.96 
 
 
393 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  29.13 
 
 
379 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 
401 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  29.45 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  26.05 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>