240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0903 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
348 aa  695    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  48.99 
 
 
347 aa  339  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  50.87 
 
 
343 aa  335  5e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  49.13 
 
 
344 aa  329  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
343 aa  325  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  46.56 
 
 
364 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  46.03 
 
 
364 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  46.56 
 
 
364 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  44.75 
 
 
364 aa  291  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  29.78 
 
 
397 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  27.3 
 
 
384 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 
383 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
384 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 
372 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.01 
 
 
367 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 
387 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 
380 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 
358 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 
389 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 
368 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 
384 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 
380 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  28.41 
 
 
396 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  29.35 
 
 
381 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 
380 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
384 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  28.65 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.08 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
371 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  27.89 
 
 
384 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  26.39 
 
 
386 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 
370 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 
386 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 
376 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  26.69 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.02 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  27.53 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  31.73 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
380 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  26.86 
 
 
389 aa  137  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  28.48 
 
 
393 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  29.66 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  28.47 
 
 
386 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.44 
 
 
378 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.87 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  26.32 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 
355 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 
385 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  29.79 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  26.72 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  28.77 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  27.1 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  29 
 
 
384 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  27.08 
 
 
386 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 
378 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  30.51 
 
 
368 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  27.66 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  28.04 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  27.27 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  27.2 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.09 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.61 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  25.6 
 
 
382 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  27.33 
 
 
382 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  26.54 
 
 
402 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  26.59 
 
 
377 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  28.81 
 
 
384 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 
436 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  28.21 
 
 
435 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  26.27 
 
 
377 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  27.49 
 
 
382 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 
401 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
379 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  26.84 
 
 
379 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  30.37 
 
 
388 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  28.37 
 
 
383 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 
380 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  28.11 
 
 
393 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  26.91 
 
 
383 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  27.39 
 
 
390 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  27.45 
 
 
385 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 
433 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  27.46 
 
 
383 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  27.61 
 
 
377 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 
411 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  29.82 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  27.41 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  25.9 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  25.9 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  27.86 
 
 
376 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  26.55 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  25.51 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  27.14 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>