241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0645 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 388 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  88.51 
 
 		 399 aa  594  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  75.26 
 
 		 386 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  74.21 
 
 		 386 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  73.95 
 
 		 386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  70.53 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  57.63 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  53.56 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  54.76 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  55.79 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  56.12 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  54.45 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  47.51 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  42.46 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  42.46 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  44.1 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  49.85 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  45.41 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  44.94 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  44.79 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  42.86 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  44.9 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  44.61 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  38.96 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  43.98 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  40.9 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  43.36 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  44.72 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  40.41 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  43.54 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  39.63 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  40.15 
 
 		 384 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  40.1 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  40.1 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  40.11 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.33 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.6 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.64 
 
 		 378 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  38.56 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.83 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  38.6 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  41.95 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  36.69 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  38.69 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  40.6 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  39.14 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  40.71 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.76 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  37.34 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.34 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  39.34 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  37.82 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  36.69 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  38.74 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  38.97 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  37.46 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  38.4 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 		 389 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.65 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.58 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  36.05 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  38.27 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.97 
 
 		 384 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  34.93 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>