240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1143 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 399 aa  800    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  62.5 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  59.9 
 
 		 391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  62.24 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  49.61 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  51.97 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  44.47 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  46.67 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  45.76 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  44.3 
 
 		 397 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  46.11 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  46.11 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  44.79 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  45.85 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  45.6 
 
 		 396 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  45.17 
 
 		 393 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  43.04 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  44.36 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  43.59 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  48.04 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  43.59 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  44.91 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  43.11 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  42.86 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 		 384 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  38.13 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  38.16 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  39.74 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 392 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  35.4 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.91 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  36.59 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  34.81 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  30.85 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.67 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.72 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  31.34 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  33.52 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  34.4 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.83 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  31.62 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  32.49 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.01 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>