240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1788 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 392 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  83.42 
 
 		 389 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  66.75 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  62.5 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  49.24 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  51.59 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  44.7 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  45.12 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  49.54 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  43.31 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  44.91 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  43.52 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  44.33 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  43.85 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  48.18 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  41.75 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  43.04 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  47.92 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  42.45 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  42.19 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  39.28 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  38.52 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  35.38 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  35.85 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 387 aa  183  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  33.83 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.63 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  33.17 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.15 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  35.26 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.74 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  35.52 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.18 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  31.78 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.82 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.63 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  36.42 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  31.57 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  33.89 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.61 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  34.68 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  31.96 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.92 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>