240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2791 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 399 aa  787    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  45.71 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  45.14 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  40.15 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  40.79 
 
 		 388 aa  215  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.88 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  36.61 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.64 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  37.04 
 
 		 384 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  37.6 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.98 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  34.64 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.8 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.44 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  36.98 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  38.54 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  37.4 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 382 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  36.66 
 
 		 382 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  35.55 
 
 		 394 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  35.55 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  36.92 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.99 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.26 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.39 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  33.05 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.84 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  38.03 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.13 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.53 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  37.68 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  36.93 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  34.08 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.38 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 377 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  36.21 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  33.17 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 377 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.71 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 380 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>