241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1394 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
388 aa  766    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  45.71 
 
 
399 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  42.19 
 
 
393 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  40.92 
 
 
397 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  39.33 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 
380 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  36.98 
 
 
407 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  39.27 
 
 
379 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  40.9 
 
 
393 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  39.06 
 
 
387 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  38.86 
 
 
396 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  38.52 
 
 
386 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
384 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  34.77 
 
 
384 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 
386 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  38.64 
 
 
379 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
384 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 
379 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 
372 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  38.32 
 
 
379 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  34.83 
 
 
383 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 
386 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  41.32 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
383 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 
383 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  40.7 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  39.31 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  40.78 
 
 
396 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 
396 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 
377 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  37.85 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  37.85 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 
394 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  35.79 
 
 
391 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  36.43 
 
 
387 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.65 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 
383 aa  172  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 
388 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 
384 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 
387 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
383 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
398 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 
380 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.28 
 
 
380 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  36.57 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 
389 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 
419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
385 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 
380 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.17 
 
 
388 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 
388 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.7 
 
 
389 aa  162  9e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 
382 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 
385 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 
389 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 
385 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 
393 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 
384 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
384 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 
399 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.95 
 
 
377 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 
375 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  27.86 
 
 
384 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 
392 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 
392 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.29 
 
 
381 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 
375 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  31.13 
 
 
393 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 
375 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  27.86 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  29.58 
 
 
371 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  28.93 
 
 
402 aa  155  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  27.49 
 
 
378 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  29.17 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 
375 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 
381 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 
380 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.44 
 
 
370 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>