240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4426 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
397 aa  769    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  55.96 
 
 
397 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  56.35 
 
 
393 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  56.63 
 
 
396 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  55.41 
 
 
393 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  55.94 
 
 
393 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  57.82 
 
 
396 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  53.7 
 
 
392 aa  348  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  52.7 
 
 
396 aa  346  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  52.63 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  51.98 
 
 
386 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  51.84 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  51.95 
 
 
399 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  53.49 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  43.65 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  43.99 
 
 
395 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  43.99 
 
 
395 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  45.62 
 
 
386 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  45.05 
 
 
387 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  44.56 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  44.3 
 
 
392 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  43.04 
 
 
399 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  44.91 
 
 
379 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 
379 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  41.75 
 
 
392 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  42.2 
 
 
389 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  44.07 
 
 
380 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  43.47 
 
 
384 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  41.5 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  42.33 
 
 
387 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  40.57 
 
 
384 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  42.04 
 
 
379 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 
407 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.68 
 
 
379 aa  205  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.99 
 
 
378 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.99 
 
 
376 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  38.52 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 
375 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  41.19 
 
 
388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.69 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  39.23 
 
 
390 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 
375 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.27 
 
 
382 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 
410 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  38.4 
 
 
389 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  38.4 
 
 
389 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  37.76 
 
 
380 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  37.8 
 
 
380 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 
389 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  38.3 
 
 
389 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 
381 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  38.68 
 
 
389 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 
389 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  38.7 
 
 
388 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  40.82 
 
 
401 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 
388 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  39.01 
 
 
389 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 
399 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.26 
 
 
378 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 
381 aa  186  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  39.31 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.15 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 
388 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 
376 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 
388 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 
388 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  39.21 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  39.21 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.92 
 
 
377 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  38.02 
 
 
377 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.53 
 
 
378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
388 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 
392 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.5 
 
 
376 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.77 
 
 
377 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 
383 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 
384 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.29 
 
 
371 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  34.16 
 
 
435 aa  176  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 
384 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 
385 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  29.61 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.6 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  36.39 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.47 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>