240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1595 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
389 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  83.42 
 
 
392 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  65.9 
 
 
391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  62.95 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  49.62 
 
 
394 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  50.52 
 
 
395 aa  359  5e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  50.52 
 
 
395 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  50.39 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  44.76 
 
 
394 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  46.95 
 
 
386 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  47.48 
 
 
386 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 
397 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  43.83 
 
 
393 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  49.85 
 
 
399 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  43.6 
 
 
393 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  43.91 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 
396 aa  252  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 
396 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  44.39 
 
 
393 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  42.2 
 
 
397 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  49.85 
 
 
388 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  42.64 
 
 
396 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 
386 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  41.42 
 
 
379 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 
379 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  41.42 
 
 
387 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  39.06 
 
 
384 aa  222  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 
387 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 
384 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 
380 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 
393 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
389 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.66 
 
 
380 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 
380 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  35.59 
 
 
407 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.92 
 
 
375 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 
379 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 
375 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.92 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.92 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 
379 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.87 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 
398 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.4 
 
 
375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  37.27 
 
 
388 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.94 
 
 
379 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 
399 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 
376 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 
377 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.92 
 
 
392 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
382 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.74 
 
 
382 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 
394 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 
394 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 
394 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
384 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  32.74 
 
 
389 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 
378 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 
376 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 
378 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 
379 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 
385 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.79 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  32.23 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  37.16 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  36.28 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.5 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 
435 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.69 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 
385 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 
433 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 
380 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 
388 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 
381 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.65 
 
 
386 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.97 
 
 
389 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 
387 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 
385 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 
388 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 
385 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 
385 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.89 
 
 
378 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 
383 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
380 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 
389 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  31.96 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  31.98 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  31.96 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 
385 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 
382 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 
383 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>