241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5143 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  97.92 
 
 		 386 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  94.04 
 
 		 386 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 386 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  77.57 
 
 		 392 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  74.21 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  73.21 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  54.86 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  52.48 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  53.52 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  51.56 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  53.02 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  53.54 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  52.09 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  45.85 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  40.84 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  40.94 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  40.94 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  45.03 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  40.17 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  41.09 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  40.93 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  39.64 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  42.26 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  42.37 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  42.74 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  42.15 
 
 		 380 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  40.26 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  43.27 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  42.98 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 		 375 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  37.93 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.21 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.74 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.78 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  37.04 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.07 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  37.72 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  39.07 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  36.01 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  37.72 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  38.37 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  37.28 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  36.71 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.06 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.84 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  36.73 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  38.62 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.34 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 385 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  35.58 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  36.76 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.13 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  41.27 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 379 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.38 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  37.75 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  37.18 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>