244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1262 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 388 aa  799    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  56.99 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 379 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  53.95 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  54.62 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  54.62 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  54.91 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  53.79 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  53.11 
 
 		 398 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  53.11 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  52.08 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  52.85 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  53.52 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  53.11 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  53.52 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  52.47 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  52.89 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  53.37 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  52.85 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  53.42 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  53.14 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  53.16 
 
 		 382 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  52.37 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  52.44 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  53 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  53.68 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  53 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  51.3 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  53.48 
 
 		 382 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  51.32 
 
 		 381 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  53.16 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  53.62 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  53.74 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  52.37 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  51.97 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  52.28 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  53.05 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  51.98 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  48.8 
 
 		 375 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  48.4 
 
 		 380 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  46.42 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  48.53 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  48.92 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  47.34 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  47.04 
 
 		 419 aa  352  8.999999999999999e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  48.27 
 
 		 375 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  48.27 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  49.6 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  50.27 
 
 		 376 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  45.89 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  47.62 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  43.68 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  46.27 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  48.02 
 
 		 378 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  46.27 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  48.16 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  42.67 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  41.1 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  43.12 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  44.95 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  43.39 
 
 		 389 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  43.35 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  47.41 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  42.59 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  44 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  41.53 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  43.54 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  44 
 
 		 377 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  41.81 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  41.03 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  41.32 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1771  lipid-A-disaccharide synthase  41.09 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.016286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  41.78 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  41.76 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2572  lipid-A-disaccharide synthase  42.34 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126435  normal  0.026533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  41.99 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  40.94 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  42.34 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 389 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 389 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  40.21 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  41.01 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  41.27 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>