242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2682 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 376 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1771  lipid-A-disaccharide synthase  82.06 
 
 		 398 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.016286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  76.66 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  68.8 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  67.47 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  68.53 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2572  lipid-A-disaccharide synthase  67.47 
 
 		 385 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126435  normal  0.026533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  67.29 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  66.4 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  61.5 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1967  lipid-A-disaccharide synthase  57.22 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  51.46 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  50.93 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  51.45 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  51.58 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  52.91 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  52.91 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  52.91 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  47.31 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  52.65 
 
 		 389 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  52.38 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  52.91 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  52.44 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  52.65 
 
 		 389 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  51.8 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  51.05 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  51.05 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  51.05 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  51.19 
 
 		 388 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  51.96 
 
 		 377 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  50.79 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  50.79 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  51.17 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  51.19 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  51.44 
 
 		 377 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  51.32 
 
 		 390 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  48.07 
 
 		 401 aa  342  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  48.68 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  45.5 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  46.63 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  46.4 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  45.89 
 
 		 375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  47.67 
 
 		 384 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  43.31 
 
 		 388 aa  317  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  45.89 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  46.03 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  45.09 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  45.77 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  45.21 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  43.73 
 
 		 386 aa  309  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  42.48 
 
 		 384 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  44.56 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  43.27 
 
 		 382 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  41.55 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  46.28 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  45.19 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  43.77 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  45.65 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  45.91 
 
 		 392 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  44.03 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  41.38 
 
 		 392 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  42.18 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  42.33 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  45.38 
 
 		 398 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  43.98 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  45.65 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  43.77 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  45.31 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  43.24 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  43.01 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  41.07 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  44.74 
 
 		 384 aa  295  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 385 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  44.95 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  44.27 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  43.92 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 383 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  42.62 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  39.52 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 		 394 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 		 394 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  39.26 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  39.52 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  38.77 
 
 		 382 aa  278  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  40.27 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  44.35 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  40.11 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>