241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00180 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 382 aa  783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  99.74 
 
 		 382 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  94.76 
 
 		 382 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  84.47 
 
 		 383 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  94.5 
 
 		 382 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  98.95 
 
 		 382 aa  775    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  98.17 
 
 		 382 aa  771    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  91.62 
 
 		 382 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  98.95 
 
 		 382 aa  775    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  98.43 
 
 		 382 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  81.58 
 
 		 382 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  94.76 
 
 		 382 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  783    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  99.74 
 
 		 382 aa  781    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  82.23 
 
 		 383 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  94.76 
 
 		 382 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  84.13 
 
 		 383 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  99.74 
 
 		 382 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  94.76 
 
 		 382 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  82.23 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  82.23 
 
 		 394 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  81.96 
 
 		 394 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  79.68 
 
 		 382 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  60.16 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  59.89 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  60.16 
 
 		 379 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  60.42 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  58.42 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  58.16 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  58.16 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  57.89 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  57.71 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  57.07 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  57.07 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  57.07 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  57.85 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  57.37 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  56.28 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  56.5 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  56.32 
 
 		 384 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  56.5 
 
 		 381 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  55.24 
 
 		 382 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  55.38 
 
 		 383 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  52.42 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  54.17 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  54.57 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  54.55 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  52.55 
 
 		 392 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  54.67 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  56.15 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  52.65 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  50.4 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  49.08 
 
 		 419 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  52.39 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  47.99 
 
 		 382 aa  363  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  52.25 
 
 		 380 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  53.19 
 
 		 378 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  48.4 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  47.33 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  45.77 
 
 		 382 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  45.89 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  48.79 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  43.28 
 
 		 376 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  50.82 
 
 		 382 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  47.08 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  42.89 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  43.97 
 
 		 385 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 		 379 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  43.08 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  44 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  39.89 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  39.63 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 389 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 388 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 376 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  39.94 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  39.62 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  39.14 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  40.26 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>