240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3148 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  80.79 
 
 		 383 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 380 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  85.26 
 
 		 384 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  78.68 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  77.63 
 
 		 384 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  77.04 
 
 		 385 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  77.04 
 
 		 385 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  77.89 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  76.78 
 
 		 385 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  77.84 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  77.63 
 
 		 398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  77.37 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  76.52 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  73.68 
 
 		 382 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  75.73 
 
 		 383 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  72.56 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  57.37 
 
 		 393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  57.68 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  57.95 
 
 		 379 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  56.57 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  57.68 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 382 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  56.28 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  56.28 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  56.28 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  57.07 
 
 		 382 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  56.27 
 
 		 383 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  56.54 
 
 		 382 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  55.73 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  56.53 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  56.53 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  55.76 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  56.53 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  55.23 
 
 		 383 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  56.53 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  55.76 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  56.53 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  55.76 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  56.27 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  55.76 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  56.06 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  52.47 
 
 		 389 aa  411  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  53.74 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  51.73 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  50.4 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  53.12 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  51.21 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  50.4 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  50.27 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  52.02 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  52.29 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  48.67 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  48.93 
 
 		 388 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  51.34 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  52.83 
 
 		 378 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  49.33 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  45.65 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  45.6 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  45.65 
 
 		 385 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  45.53 
 
 		 376 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  44.83 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  45.74 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  47.51 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  43.28 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  43.55 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  44.05 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  44.27 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  43.88 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  43.42 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  43.42 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  43.42 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  45.05 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  43.27 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  45.31 
 
 		 388 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  43.2 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  43.32 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  43.16 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  42.89 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  42.33 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>