240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1355 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  92.04 
 
 		 390 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  97.61 
 
 		 377 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 377 aa  765    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  74.6 
 
 		 402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  75.13 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  64.8 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  64.8 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  64.53 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  61.87 
 
 		 389 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  64.44 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  65.16 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  61.87 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  64.44 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  64.27 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  60.7 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  62.67 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  61.33 
 
 		 388 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  61.33 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  61.33 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  61.07 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  61.33 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  61.33 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  61.07 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  51.65 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  52.17 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  50.94 
 
 		 385 aa  362  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  50.53 
 
 		 382 aa  355  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  51.44 
 
 		 376 aa  345  8e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  54.57 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  52.24 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1771  lipid-A-disaccharide synthase  50.65 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.016286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  51.19 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  48.5 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  48.13 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  46.74 
 
 		 388 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2572  lipid-A-disaccharide synthase  50.66 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126435  normal  0.026533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  50.84 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  47.86 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  47.21 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  46.15 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1451  lipid-A-disaccharide synthase  49.07 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  51.06 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1967  lipid-A-disaccharide synthase  49.06 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  47.44 
 
 		 376 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 		 378 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  50.81 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  44.24 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  44.41 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  43.32 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  45.11 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  43.39 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  43.47 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  45.14 
 
 		 377 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  44.38 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  45.7 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  43.73 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  42.44 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  43.95 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  44.95 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  44.18 
 
 		 385 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  43.05 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  42.67 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  42.67 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  42.86 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  42.44 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  42.25 
 
 		 379 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  39.3 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  43.49 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  39.42 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  39.35 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  39.62 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  42.74 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  38.67 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.81 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  38.24 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  39.08 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  38.81 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  38.81 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 379 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>