241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1356 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  86.22 
 
 
375 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  91.89 
 
 
380 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
380 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  86.22 
 
 
375 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  84.86 
 
 
375 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  84.32 
 
 
375 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  83.91 
 
 
376 aa  597  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  75.6 
 
 
377 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  76.13 
 
 
378 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  77.19 
 
 
378 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  70.79 
 
 
380 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  58.82 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  55.38 
 
 
388 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
398 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  54.4 
 
 
392 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
398 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
398 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  55.8 
 
 
385 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  53.19 
 
 
393 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  56.32 
 
 
386 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  53.6 
 
 
393 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  53.85 
 
 
383 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
385 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  53.33 
 
 
385 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  53.33 
 
 
385 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  53.6 
 
 
385 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  53.37 
 
 
382 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  53.7 
 
 
394 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  53.07 
 
 
384 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  53.7 
 
 
394 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  54.4 
 
 
382 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  51.33 
 
 
378 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  53.87 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 
379 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  52.27 
 
 
383 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  53.44 
 
 
394 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  54.4 
 
 
382 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  50.93 
 
 
383 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  53.87 
 
 
382 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  50.92 
 
 
384 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  51.98 
 
 
382 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  54.13 
 
 
382 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  53.58 
 
 
383 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  50.67 
 
 
382 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  53.72 
 
 
383 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 
379 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  50.4 
 
 
380 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  48.42 
 
 
389 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 
379 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  47.91 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  47.89 
 
 
381 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  51.87 
 
 
402 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  46.34 
 
 
376 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  45.03 
 
 
383 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  55.22 
 
 
382 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  48.4 
 
 
388 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 
419 aa  339  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  48.01 
 
 
389 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  45 
 
 
382 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  46.32 
 
 
389 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  50 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  50.8 
 
 
401 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  46.05 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  49.73 
 
 
377 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  47.51 
 
 
385 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 
390 aa  329  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  45.21 
 
 
385 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  47.32 
 
 
372 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  49.34 
 
 
379 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  47.07 
 
 
385 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  48.2 
 
 
384 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  46.81 
 
 
385 aa  318  9e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  46.4 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  49.47 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  47.2 
 
 
389 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  49.33 
 
 
388 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
388 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  47.2 
 
 
389 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
388 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
388 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  44.71 
 
 
385 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
388 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  48.28 
 
 
388 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  49.06 
 
 
388 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  46.6 
 
 
389 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  46.6 
 
 
389 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  46.6 
 
 
389 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  46.75 
 
 
401 aa  308  9e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  47.48 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>