240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1374 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  99.21 
 
 		 379 aa  737    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  92.61 
 
 		 387 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 379 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  63.14 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  59.84 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  62.27 
 
 		 380 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  62.11 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  47.38 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  46.46 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  44.83 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  44.97 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  46.46 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  44.88 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  44.91 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  43.65 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  43.39 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  40.9 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  44.47 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  42.37 
 
 		 386 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  41.84 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  42.06 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  41.84 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  42.45 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  43.11 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  41.82 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  40.38 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  41.42 
 
 		 389 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  42.63 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  41.1 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  38.7 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  38.55 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  37.67 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 382 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 375 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  37.14 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.15 
 
 		 377 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.86 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.56 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.67 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.82 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  36.08 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  37.54 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  31.78 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  36.93 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  37.82 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  37.54 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  37.93 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.01 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.01 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  37.24 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>