244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1854 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 388 aa  785    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  41.05 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  38.58 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  41.39 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  42.64 
 
 		 380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  45.35 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  44.29 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  39.03 
 
 		 379 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  41.01 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  38.57 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  43.21 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  37.95 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  41.14 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  43.14 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  38.66 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  38.57 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  45.13 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  45.13 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  40.9 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  39.22 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  44.85 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  45.13 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  42.06 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  45.35 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 383 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  38.2 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  44.84 
 
 		 375 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  45.16 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  39.78 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  41.76 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  40.98 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  39.94 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  45.87 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  44.35 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  41.67 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  40.35 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  38.84 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  38.84 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  38.36 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  42.94 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  38.84 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  42.66 
 
 		 385 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  40.87 
 
 		 385 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  41.81 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  39.53 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  40.26 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  41.57 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  39.79 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  39.59 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  39.35 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  39.11 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  36.84 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  42.64 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.77 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  39.71 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  37.15 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  37.84 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 		 379 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.87 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  37.9 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  40.63 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  36.56 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  37.84 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  36.5 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34.36 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  37.05 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  38.05 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>