240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2449 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 396 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  70.28 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  72.44 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  68.97 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  73.89 
 
 		 393 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  69.41 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  69.95 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  57.82 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  56.23 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  54.07 
 
 		 386 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  53.54 
 
 		 386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  53.54 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  56.12 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  54.52 
 
 		 399 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  44.65 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  41.56 
 
 		 394 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  42.49 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  42.49 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  42.48 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  45.12 
 
 		 392 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  44.97 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  43.59 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  44.47 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  44.47 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  41.67 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  44.16 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  42.64 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  42.63 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  41.84 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  39.06 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  39.15 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  37.84 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  38.54 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  40.62 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.08 
 
 		 386 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  37.63 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  36.05 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  40.78 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.28 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  37.89 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  35.93 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  36.78 
 
 		 381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  35.92 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.24 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  33.76 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  35.79 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  36.52 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  36.07 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  36.07 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.79 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  31.87 
 
 		 381 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  35.08 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  36.2 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  34.01 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>