252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2837 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 389 aa  788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  46.25 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  43.62 
 
 		 384 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  46.21 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  43.92 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  41.67 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  42.86 
 
 		 372 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  43.35 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  41.78 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  38.85 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  38.85 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  40.58 
 
 		 380 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  39.21 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.81 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  41.35 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  41.08 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  40.72 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  41.08 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  40.6 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  39.89 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  39.58 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  41.42 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  37.9 
 
 		 368 aa  252  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  39.19 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  37.9 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  39.62 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 392 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.68 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.54 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  34.85 
 
 		 378 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.52 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  33 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  32.44 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  34.87 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  37.43 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.33 
 
 		 378 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  37.35 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 		 376 aa  216  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.78 
 
 		 376 aa  215  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  33.87 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  38.62 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  35.33 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  36.16 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 385 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.7 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.12 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  33.61 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  33.61 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  36.72 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 384 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  36.57 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>