241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0943 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 391 aa  810    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  36.46 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  29.18 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  32.47 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 380 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  28.39 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  31.22 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  31.98 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  29.95 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.85 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.36 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.06 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.13 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  34.24 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  33.54 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  32.07 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  34.36 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  31.48 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 		 371 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  33.13 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.84 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  30.14 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.24 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.52 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.83 
 
 		 392 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 398 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  33.8 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.92 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  33.8 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.42 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.81 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  31.33 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  31.22 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  28.65 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>