240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2572 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 368 aa  760    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  58.71 
 
 		 377 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  55.86 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  54.47 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  53.68 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  53.23 
 
 		 371 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  52.99 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  52.62 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  48.65 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  37.97 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  38.65 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.71 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.49 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  38.51 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34.57 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  35.97 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.8 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  38.12 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.83 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 382 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.45 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.01 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.27 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  35.12 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  34.17 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  34.93 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 		 385 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  36.5 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  34.36 
 
 		 380 aa  202  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  31.69 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  34.08 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  35.63 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  36.21 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.64 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.27 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  31.22 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  30.94 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  35.8 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  30.94 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  32.58 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.63 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.64 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.25 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  33.44 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.36 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>