240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2162 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  100 
 
 		 383 aa  791    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  45.58 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  44.15 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  42.16 
 
 		 376 aa  271  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  42.04 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  41.94 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  42.77 
 
 		 367 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  36.91 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 384 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.07 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  34.07 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  33.33 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.42 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.2 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.77 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  33.74 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.4 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  33.5 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.82 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.17 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  30.95 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  29.26 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  29.63 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  29.41 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  29.47 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.9 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>