245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0412 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 402 aa  827    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  59.52 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  59.79 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  58.84 
 
 		 380 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  57.22 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  56.61 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  55.82 
 
 		 380 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.54 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  39.56 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  34.74 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.29 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.29 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  32.12 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.31 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  34.01 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  37.09 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.73 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  36.75 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  31.99 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.4 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  34.22 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.95 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  34.76 
 
 		 384 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.4 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  31.22 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  34.78 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  35.8 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  35.53 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.31 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  34.31 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  30.71 
 
 		 398 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  36.45 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  30.49 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  31.83 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  30.26 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.92 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>