242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0411 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
380 aa  764    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  70.79 
 
 
380 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  66.05 
 
 
380 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  64.21 
 
 
382 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  61.84 
 
 
380 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  56.61 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  56.2 
 
 
383 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  39.47 
 
 
384 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  39.11 
 
 
384 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  39.02 
 
 
384 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 
379 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  36.54 
 
 
379 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 
382 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  37.67 
 
 
384 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 
384 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 
410 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  35.12 
 
 
387 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 
383 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  38.55 
 
 
383 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  33.97 
 
 
380 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 
377 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 
380 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  39.12 
 
 
377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 
372 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.95 
 
 
389 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  38.55 
 
 
383 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 
383 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 
388 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 
392 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 
367 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 
388 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 
376 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 
388 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  35.1 
 
 
376 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 
371 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 
384 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 
384 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.37 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 
411 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  30.11 
 
 
370 aa  187  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 
388 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 
388 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  30.1 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  30.1 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 
382 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  30.61 
 
 
435 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  32.13 
 
 
376 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.1 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.82 
 
 
389 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  28.16 
 
 
382 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  31.41 
 
 
401 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 
388 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
393 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  31.45 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.43 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  34.12 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  34.76 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  30.68 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 
385 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 
384 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  30.06 
 
 
382 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 
389 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 
392 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  31.51 
 
 
379 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2087  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 
389 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
385 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  33.92 
 
 
377 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
385 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 
382 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  27.87 
 
 
436 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 
377 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  31.18 
 
 
389 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 
383 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  28.01 
 
 
383 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  30.88 
 
 
382 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  30.11 
 
 
391 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  28.01 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  27.14 
 
 
433 aa  166  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  28.31 
 
 
382 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.34 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 
376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  32.25 
 
 
392 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 
379 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>