242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2052 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 376 aa  765    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  36.55 
 
 		 379 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  36.01 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 376 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.79 
 
 		 384 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.16 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  35.11 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  33.67 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  32.91 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.63 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  34.56 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.91 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  32.13 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.45 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  31.32 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  30.9 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  30.55 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2087  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  32.47 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  29.92 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  32 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  31.83 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.58 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 385 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.37 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>