245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0488 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 381 aa  769    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  47.71 
 
 		 410 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  46.34 
 
 		 378 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  43.63 
 
 		 376 aa  311  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  43.56 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  40.48 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  41.18 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  41.18 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  39.66 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 377 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  38.71 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  39.9 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.72 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  38.54 
 
 		 375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  38.77 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  38.54 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  38.83 
 
 		 379 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  38.64 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  37.93 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  37.21 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  37.21 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34.42 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  36.95 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  38.38 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  38.14 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.93 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  35.94 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  28.88 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  36.8 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 384 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  34.13 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  32.53 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.14 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  35.88 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  35.9 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  35.62 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>