243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2192 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 372 aa  775    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  71.04 
 
 		 371 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  69.95 
 
 		 370 aa  538  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  57.1 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  53.55 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  52.99 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  47.49 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  49.33 
 
 		 378 aa  342  9e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  44.65 
 
 		 370 aa  305  7e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  43.19 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  39.89 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.73 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  36.34 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.95 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  34.32 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.1 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  35.04 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  36.41 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  33.06 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 392 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.79 
 
 		 387 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.51 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.58 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  34.33 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.33 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 385 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.67 
 
 		 385 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  34.37 
 
 		 377 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.36 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  36.28 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 384 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  32.85 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.07 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.11 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  30.97 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  36.73 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.52 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.2 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  31.83 
 
 		 358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  34.6 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  34.33 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  32.16 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.13 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  33.04 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.65 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>