244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0104 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
355 aa  716    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 
388 aa  248  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.25 
 
 
383 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.6 
 
 
384 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.6 
 
 
372 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.14 
 
 
379 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  29.89 
 
 
372 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 
384 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  30.41 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  34.6 
 
 
370 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 
389 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 
380 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
376 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 
380 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.36 
 
 
371 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.61 
 
 
378 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.42 
 
 
367 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 
376 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 
410 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 
384 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  28.04 
 
 
384 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  28.07 
 
 
381 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  32.15 
 
 
363 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 
343 aa  159  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  27.7 
 
 
383 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.72 
 
 
384 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
382 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  27.98 
 
 
375 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  27.98 
 
 
375 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  30.38 
 
 
388 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 
364 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  28.92 
 
 
380 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 
372 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 
411 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  27.18 
 
 
383 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  27.18 
 
 
383 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  25.94 
 
 
368 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.3 
 
 
378 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  27.59 
 
 
379 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  26.44 
 
 
377 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  31.06 
 
 
376 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  27.58 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
388 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 
344 aa  147  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 
377 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  27.63 
 
 
402 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  34.26 
 
 
364 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  34.98 
 
 
347 aa  146  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 
364 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  28.02 
 
 
384 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  29.63 
 
 
376 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 
388 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  28.12 
 
 
383 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 
376 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 
382 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  27.03 
 
 
380 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.2 
 
 
368 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
380 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  33.68 
 
 
344 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  28.76 
 
 
385 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.33 
 
 
382 aa  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 
383 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  27.87 
 
 
370 aa  142  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.23 
 
 
379 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 
378 aa  142  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  34.42 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  26.2 
 
 
383 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  30.38 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0911  lipid-A-disaccharide synthase  29.47 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  30.11 
 
 
401 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 
385 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  29.12 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  28.74 
 
 
375 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  26.56 
 
 
383 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 
385 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  29.71 
 
 
384 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  25.34 
 
 
382 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 
392 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 
375 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 
385 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 
398 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  26.33 
 
 
392 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1506  lipid-A-disaccharide synthase  29.47 
 
 
436 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218867  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  30.09 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 
398 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 
388 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 
398 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 
384 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  31.11 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  28.73 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  25.68 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  29.01 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>