240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3095 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 388 aa  752    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  61.7 
 
 		 379 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  45.77 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  44.57 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  43.54 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  43.04 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  45.24 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  41.98 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  43.7 
 
 		 379 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  43.36 
 
 		 375 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  43.7 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  43.36 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  43.36 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  41.44 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  43.26 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  43.06 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  40.77 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  42.15 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  44.32 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  39.29 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  44.77 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  41.58 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  42.36 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  39.16 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  40.79 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  38.26 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  45.22 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  37.87 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  36.18 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  41.23 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  37.05 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  38.13 
 
 		 398 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  37.87 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  38.13 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  44.32 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  40.84 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  43.88 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  44.31 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.77 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  36.16 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  37.87 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  35.69 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  43.48 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  42.98 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  37.75 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  40.36 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  39.64 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  37.68 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  37.68 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  40.8 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  39.82 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  42.9 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  39.82 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  39.82 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  39.55 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  37.39 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  39.41 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  40.77 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  38.8 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  38.92 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  40.5 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  38.51 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  37.99 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  34.47 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.67 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  39.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  39.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  39.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  39.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0270  lipid-A-disaccharide synthase  39.51 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  42.82 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  39.56 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>