245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0475 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 380 aa  772    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  65.79 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  61.84 
 
 		 380 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  58.95 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  58.42 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  55.82 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  53.44 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.48 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  34.92 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  34.85 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.85 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  34.71 
 
 		 387 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 		 379 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  36.68 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  37.99 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.82 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  36.92 
 
 		 377 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.71 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  37.73 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.97 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  32.88 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  34.14 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.85 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32.89 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.61 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.2 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  31.4 
 
 		 378 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.18 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.58 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.18 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  32.87 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  33.62 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2087  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 375 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.42 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.22 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  32.76 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.9 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  32.74 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.75 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.06 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  31.61 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  30.69 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  32.95 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  29.89 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  30.42 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  31.12 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  29.21 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.86 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  29.58 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  33.96 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  33.98 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.12 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  29.81 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>