254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5044 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  65.01 
 
 		 386 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  65.01 
 
 		 386 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  63.25 
 
 		 384 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  61.52 
 
 		 385 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  60.76 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  55.38 
 
 		 385 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  53.66 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  48.58 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  44.96 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  44.7 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  46.25 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  45.24 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  41.75 
 
 		 392 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  41.75 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  41.75 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  40.41 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  45.9 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.79 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.18 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  32.62 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  32.73 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.79 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.25 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.98 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  30.29 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.09 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  33.42 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  30.16 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 380 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  28.91 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  31.94 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 		 375 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  30.68 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 		 380 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  30.33 
 
 		 379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.03 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  30.83 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  29.92 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  28.28 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  29.09 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 394 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  29.51 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  28.18 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  30.61 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  31.1 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  29.73 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 382 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  31.68 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  29.76 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  29.79 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  31.39 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 		 385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.95 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  32.32 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  30.43 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>