240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15341 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  89.8 
 
 		 392 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  92.35 
 
 		 392 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 392 aa  788    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  76.28 
 
 		 392 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  52.96 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  52.19 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  49.74 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  52.33 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  47.57 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  44.99 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  46.92 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  42.49 
 
 		 385 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  41.45 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  41.49 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  39.49 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  42.75 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  42.75 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 		 384 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  28.08 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.5 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  29.85 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.12 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  29.05 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  26.58 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  26.86 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  28.06 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  28.39 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  25.83 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28.13 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  29.26 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  29.13 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  26.79 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  26.53 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  32.07 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  29.16 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  26.12 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.06 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  25.78 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.2 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  29.67 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.05 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.51 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.61 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  27.89 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  31.91 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  27.6 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  26.82 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  24.23 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  27.25 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  25.26 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  26.91 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  25.95 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  25.71 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  25.88 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  26.38 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  25.96 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  27.3 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  25.41 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  28.94 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  26.16 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  29.07 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  24.87 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  27.07 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0255  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  26.81 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  26.81 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.660379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  27.08 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  24.5 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>