242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0905 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 390 aa  776    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  98.72 
 
 		 390 aa  768    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  62.98 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  59.02 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  53.57 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  54.24 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  52.96 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  52.96 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  50.13 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  52.94 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  45.24 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  45.64 
 
 		 385 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  46.89 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  44.7 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  44.96 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  44.96 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  43.22 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  40.87 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  30.03 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.33 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.79 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  28.46 
 
 		 386 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  28.53 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.23 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  29.64 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  26.74 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  29.49 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  26.99 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  28.16 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  28.97 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  28.37 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.36 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  27.06 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.67 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.9 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  28.39 
 
 		 370 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.42 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 380 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  29.11 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  27.37 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  27.58 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  26.1 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  27.93 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  29 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  26.1 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  27.5 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  27.75 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  30.2 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  26.92 
 
 		 379 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  28.54 
 
 		 370 aa  143  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  28.31 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  27.51 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.66 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  29.38 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  28.35 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  28.43 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  25.76 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  28.06 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  26.75 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  24.16 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  29.16 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  27.75 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>