250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3322 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
413 aa  836    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  63.54 
 
 
384 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  60.91 
 
 
385 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  60.76 
 
 
384 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  55.22 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  55.22 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  55.95 
 
 
385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  52.62 
 
 
399 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  45.06 
 
 
390 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  44.92 
 
 
392 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  43.22 
 
 
390 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  42.71 
 
 
390 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  43.8 
 
 
393 aa  353  4e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  41.07 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  40.1 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  39.75 
 
 
392 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  39.49 
 
 
392 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  43.32 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.67 
 
 
384 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  32.58 
 
 
383 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  32.16 
 
 
392 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  30.46 
 
 
384 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.14 
 
 
379 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  29.59 
 
 
372 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.49 
 
 
388 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.49 
 
 
376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  29.71 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 
384 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  28.64 
 
 
380 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.08 
 
 
392 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 
380 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  28.14 
 
 
363 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  29.68 
 
 
384 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.62 
 
 
384 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  27.99 
 
 
379 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 
389 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 
376 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  29.8 
 
 
383 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 
389 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.5 
 
 
388 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.46 
 
 
377 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
380 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  29.4 
 
 
384 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
383 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
383 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  28.99 
 
 
389 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 
389 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.69 
 
 
388 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  29.8 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  27.54 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  28.28 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  27.92 
 
 
379 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  30.28 
 
 
393 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.02 
 
 
384 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 
377 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  29.5 
 
 
394 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  29.5 
 
 
394 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  31.9 
 
 
367 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  29.5 
 
 
394 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 
411 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  28.06 
 
 
378 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  27.92 
 
 
380 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  30.38 
 
 
393 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.47 
 
 
368 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  27.39 
 
 
380 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  27.96 
 
 
385 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  29.62 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  31.27 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  29.8 
 
 
383 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.9 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  29.07 
 
 
384 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 
389 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  28.68 
 
 
389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  26.72 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  29.61 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  29.61 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  29.51 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  29.61 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  29.57 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  28.89 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  27.71 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  29.29 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  29.95 
 
 
388 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  30.07 
 
 
392 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  30.17 
 
 
398 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.15 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  29.78 
 
 
381 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  29.23 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  30.5 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  30.18 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  27.96 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  28.36 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>