243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0932 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 399 aa  797    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  56.54 
 
 		 384 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  51.87 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  53.93 
 
 		 385 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  52.36 
 
 		 386 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  52.36 
 
 		 386 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  53.14 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  52.62 
 
 		 385 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  51.79 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  51.04 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  46.89 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  46.63 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  46.02 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  44.99 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  46.63 
 
 		 390 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  45.76 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  44.22 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  51.67 
 
 		 393 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 392 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  35.43 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  30.14 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  29.82 
 
 		 380 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.59 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  29.34 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28.91 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.43 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  29.84 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.21 
 
 		 376 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  30.42 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.97 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 371 aa  163  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.04 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.65 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  30.4 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  29.09 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  27.81 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  32.08 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  31.81 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.78 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  28.93 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 385 aa  156  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  29.73 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  31.54 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  28.99 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.72 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  29.89 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  31.98 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  30.88 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.09 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.52 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  30.08 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  29.44 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.23 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  28.98 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  28.98 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  29.97 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  29.21 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  28.24 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.18 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  27.64 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  33.15 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>