244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4501 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
385 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  59.9 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  58.49 
 
 
385 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  55.95 
 
 
413 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  55.38 
 
 
384 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  51.18 
 
 
386 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  51.18 
 
 
386 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  52.62 
 
 
399 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  48.47 
 
 
392 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0558  lipid-A-disaccharide synthase  46.43 
 
 
393 aa  338  8e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.142722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13881  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 
390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.732137  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  40.87 
 
 
390 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  40.62 
 
 
390 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2115  lipid-A-disaccharide synthase  47.81 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895943  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15201  lipid-A-disaccharide synthase  36.01 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  36.79 
 
 
392 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14951  lipid-A-disaccharide synthase  35.57 
 
 
392 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.822879  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15341  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 
392 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  34.46 
 
 
384 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  34.54 
 
 
384 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
384 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 
383 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  32.69 
 
 
387 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 
388 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  30.45 
 
 
372 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  29.06 
 
 
379 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 
392 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
379 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 
376 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  27.6 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.41 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  30.21 
 
 
384 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  29.92 
 
 
380 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 
392 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  32.72 
 
 
383 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
380 aa  179  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  30.96 
 
 
380 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 
383 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 
383 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 
377 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  32.69 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  31.95 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  29.14 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.77 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
377 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 
402 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.47 
 
 
388 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  31.61 
 
 
370 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  30.26 
 
 
382 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 
376 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.39 
 
 
381 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.09 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  32.9 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  32.55 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  29.92 
 
 
380 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  30.05 
 
 
419 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  28.72 
 
 
388 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 
384 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.09 
 
 
388 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  29.72 
 
 
389 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.43 
 
 
383 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  30.57 
 
 
385 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  31.77 
 
 
379 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  31.96 
 
 
389 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.89 
 
 
380 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  31.47 
 
 
393 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 
372 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  29.4 
 
 
384 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
378 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  31.01 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  31.96 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  28.76 
 
 
379 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  30.31 
 
 
385 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.99 
 
 
389 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  28.97 
 
 
370 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  29.53 
 
 
379 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
382 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.36 
 
 
376 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  29.54 
 
 
384 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 
394 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  29.66 
 
 
382 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  29.31 
 
 
391 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
385 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 
394 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  34.43 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
375 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 
394 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 
375 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  28.17 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  30.53 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>