240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2815 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 393 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  90.31 
 
 		 393 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  72.37 
 
 		 393 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  70.36 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  66.16 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  73.89 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  68.04 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  55.94 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  56.43 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  54.07 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  53.28 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  53.02 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  54.74 
 
 		 399 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  55.79 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  46.83 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  48.81 
 
 		 392 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  44.39 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  45.08 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  45.08 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  46.72 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  46.72 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  46.46 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  45.17 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  42.78 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  45.74 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  44.39 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  43.01 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  41.01 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  40.95 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  39.12 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  37.04 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  40.88 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  36.8 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 386 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  40.52 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  38.34 
 
 		 380 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  37.97 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  39.32 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  38.26 
 
 		 380 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  36.32 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.87 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  36.91 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 376 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.07 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.48 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  36.28 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  37.92 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  33.17 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  36.42 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  36.42 
 
 		 398 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  36.42 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.82 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  38.37 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  34.38 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.3 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  36.44 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  38.14 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  38.14 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  36.49 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  34.01 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  37.08 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.38 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  35.61 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  35.26 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  31.35 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.18 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  32.39 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  31.61 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  31.7 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  34.11 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>