240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1402 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 386 aa  774    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  64.25 
 
 		 380 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  63.66 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  62.63 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  62.37 
 
 		 379 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  57.55 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  57.51 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  44.39 
 
 		 397 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  42.53 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  45.62 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  44.64 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  43.63 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  39.69 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  42.05 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  45.3 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  44.03 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  42.23 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  41.97 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  42.15 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  42.15 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  40.93 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  44.16 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  41.86 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  43.06 
 
 		 396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  41.98 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  41.87 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  41.57 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  42.25 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  41.57 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  38.95 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  39.42 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  39.64 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  40.87 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  40.38 
 
 		 392 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  40.46 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  40.53 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  43.44 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  40.24 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  39.82 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  38.68 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  38.1 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  41.9 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  40.41 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  38.22 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  40.64 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  40.24 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  40.06 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  39.82 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  39.82 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  38.78 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  37.93 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  38.66 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  39.28 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  39.66 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  35.31 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.43 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  39 
 
 		 382 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  37.33 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  37.64 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  36.81 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  38.65 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  40.52 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  38.38 
 
 		 389 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  38.44 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  39.33 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.68 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  38.76 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  38.61 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  38.38 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  39.88 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  36.24 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  38.46 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  37.61 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>