241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1846 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 396 aa  789    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  78.93 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  67.27 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  67.44 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2844  lipid-A-disaccharide synthase  66.58 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2815  lipid-A-disaccharide synthase  68.04 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2449  lipid-A-disaccharide synthase  69.95 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  53.79 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  53.81 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  54.07 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  54.35 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4426  lipid-A-disaccharide synthase  52.7 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1526  lipid-A-disaccharide synthase  53.93 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0645  lipid-A-disaccharide synthase  54.45 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  44.25 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3182  lipid-A-disaccharide synthase  46.03 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.701362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  43.99 
 
 		 395 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  43.99 
 
 		 395 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0594  lipid-A-disaccharide synthase  42.49 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00179618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1143  lipid-A-disaccharide synthase  45.6 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582133  normal  0.762709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 		 392 aa  279  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  44.44 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2511  lipid-A-disaccharide synthase  41.6 
 
 		 391 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  43.85 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1595  lipid-A-disaccharide synthase  43.19 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  46.04 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  45.75 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1402  lipid-A-disaccharide synthase  44.19 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1504  lipid-A-disaccharide synthase  42.97 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00835265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  40.21 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  38.56 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3909  lipid-A-disaccharide synthase  41.47 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  42.11 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  41.03 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  38.73 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2791  lipid-A-disaccharide synthase  37.91 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.86 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  37.82 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  39.48 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.48 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  35.49 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 		 380 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  34.28 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.51 
 
 		 383 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.23 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1394  lipid-A-disaccharide synthase  37.37 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295043  normal  0.0154859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  35.73 
 
 		 389 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.34 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.34 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  34.29 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 		 368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  37.12 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  31.34 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  35.54 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  34.21 
 
 		 372 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  32.19 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  34.2 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  34.1 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  34.96 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  33.25 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>