93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2416 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2416  PKD  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2674  hypothetical protein  30.6 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.96 
 
 
1667 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  44.68 
 
 
865 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  39.39 
 
 
530 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.06 
 
 
528 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40 
 
 
963 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.75 
 
 
910 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.5 
 
 
941 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.94 
 
 
1120 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.62 
 
 
467 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  37.18 
 
 
677 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2680  hypothetical protein  28.16 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593402  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  38.55 
 
 
1150 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.53 
 
 
1862 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.75 
 
 
547 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  27.78 
 
 
500 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36.14 
 
 
1057 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  35.94 
 
 
561 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  28.28 
 
 
870 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.82 
 
 
625 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  42.86 
 
 
2000 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  35.94 
 
 
1282 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.81 
 
 
1094 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.71 
 
 
2554 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30 
 
 
2272 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.94 
 
 
594 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  31.71 
 
 
1732 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  34.44 
 
 
816 aa  46.2  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  37.68 
 
 
487 aa  45.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.38 
 
 
1682 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.18 
 
 
3295 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  34.38 
 
 
575 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.38 
 
 
1842 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  42.31 
 
 
971 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
845 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.57 
 
 
1916 aa  45.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  33.85 
 
 
519 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  34.21 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  34.21 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  34.21 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  34.21 
 
 
778 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  33.8 
 
 
769 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 
719 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 
947 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  35.94 
 
 
644 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  40 
 
 
1367 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.75 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  35.53 
 
 
1602 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  34.74 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  44 
 
 
816 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40.68 
 
 
1236 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  32.97 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  34.38 
 
 
848 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.25 
 
 
859 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.94 
 
 
2122 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.38 
 
 
551 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  34.38 
 
 
791 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.09 
 
 
752 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  34.67 
 
 
943 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  35.71 
 
 
780 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.94 
 
 
1356 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 
1361 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.38 
 
 
978 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  35.94 
 
 
1241 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  35.48 
 
 
567 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.38 
 
 
2036 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.25 
 
 
958 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.99 
 
 
1387 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0877  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 
496 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  34.38 
 
 
1882 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  38.03 
 
 
2066 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  33.85 
 
 
1667 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 
823 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  36.92 
 
 
669 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  32.81 
 
 
615 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  37.78 
 
 
552 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 
802 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  32.81 
 
 
679 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.81 
 
 
581 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.92 
 
 
1001 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  39.34 
 
 
525 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.81 
 
 
713 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.38 
 
 
1300 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  42.22 
 
 
1606 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.75 
 
 
386 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.48 
 
 
639 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.81 
 
 
735 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  29.03 
 
 
819 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.58 
 
 
869 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.38 
 
 
1969 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  34.62 
 
 
400 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.85 
 
 
1531 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>