More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0877 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0877  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 496 aa  1004    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  33.12 
 
 		 317 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.48 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 537 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.4 
 
 		 638 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.9 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.48 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.79 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  27.27 
 
 		 1300 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.89 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.88 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.93 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  34.86 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.37 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.13 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27.54 
 
 		 679 aa  67  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.26 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.83 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.61 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.63 
 
 		 1094 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  28.31 
 
 		 859 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.32 
 
 		 679 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  28.12 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  32.39 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.9 
 
 		 752 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  35.25 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.58 
 
 		 2036 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  31.48 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  42.35 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.09 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  26.35 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.76 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.05 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.51 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  26.11 
 
 		 791 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.94 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.53 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.14 
 
 		 1842 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.71 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  28.86 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.36 
 
 		 294 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.19 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  30.92 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  27.74 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  34.12 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  24.58 
 
 		 1120 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1667 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  33.68 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.29 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.49 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  32.71 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  26.4 
 
 		 735 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  27.59 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  27.33 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  25 
 
 		 1882 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  33.87 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  28.57 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  34.91 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.33 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.92 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  31.36 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.88 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  36.11 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  37.62 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.71 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.06 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  24.86 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  32.79 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.76 
 
 		 734 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>