More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2118 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.66 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  29.54 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  34.55 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  34.92 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 290 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  35.55 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  32.28 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 273 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  31.5 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  29.76 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.17 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  33.06 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  30.71 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  31.35 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  33.06 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  27.06 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 286 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21240  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.95 
 
 		 495 aa  72  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.79369  normal  0.660906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.222578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>